داستان بازی Far Cry 5 شما را در نقش نایب‌رییس کلانتر در شهری قرار می‌دهد که انگار از مابقی دنیا جدا شده و تنها، توسط گروه پست‌فطرت و وحشی «پروژه‌ای در دروازه‌ی بهشت» (The Project at Eden’s Gate)، کنترل می‌شود.

شهری که در آن نشان و جایگاه کلانتر هیچ ارزشی ندارد و بازیکن باید با اراده و تلاش خودش و بهره بردن از کمک‌های مردم هوپ کانتی، دوباره امنیت و عدالت را به تمامی نقاط آن بازگرداند. ماجرا، درباره‌ی مردی با نام جوزف سید است که از شهر ناکجاآبادی از ایالت جورجیا به این‌جا آمده و تا پیش از یک معجزه، زندگی‌اش هیچ معنا و هدفی نداشته است.

او ادعا می‌کند که به خاطر آن معجزه، با خدا صحبت کرده و خدا از او خواسته که تا پیش از به پایان رسیدن دنیا و برپایی رستاخیز، تا جای ممکن روح انسان‌های بیشتر و بیشتری را نجات دهد.با این حال، جوزف که «پدر» خطابش می‌کنند، به جای انتخاب کردن راهی صلح‌جویانه و آرامش‌بخش برای دعوت مردم، قصد انجام صحیح این کار با وحشیانه‌ترین روش‌های ممکن را دارد.

شخصی که توسط مردان و زنانی که آن‌ها را پیام‌رسان‌هایش خطاب می‌کند و صد البته ارتشی از متعصبان پشتیبانی شده و به این سادگی‌ها شکست نمی‌خورد.خود جوزف، می‌گوید برخلاف انتخاب‌شدگان قبلی، خداوند به هیچ‌کس اجازه نخواهد داد که او را از جایگاهش پایین بکشد و به همین سبب، در نهایت آرامش و قدرت در حال راهنمایی کردن اجباری مردمان شهر و آماده کردن آن‌ها برای نابودی نهایی است.

نتیجه‌ی کارهای او هم چیزی به جز ایجاد شدن ده‌ها جسد و جاری شدن یک دریا خون نیست؛ به همین دلیل هم هر چه زودتر، باید جلوی این مرد را گرفت و او را به زانو درآورد.